法律分析：保险合同是双方约定的合法文书，保险公司需按照合同条款承担赔偿责任。保险公司可以拒赔，但需证明合同中约定的保险责任不适用于本案情况。
法律依据：
1.《中华人民共和国合同法》第六十二条：当事人应当按照约定履行合同义务。
2.《中华人民共和国保险法》第：保险合同应当符合法律、行规的规定。
3.《中华人民共和国保险法》第四十二条：被保险人或者受益人有权向保险人请求给付保险金。
4.《中华人民共和国刑法》第二百二十七条：医疗单位的医务人员，在诊治中因故意或者重大过失致使患者死亡或者造成重大损害的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
综上所述，保险公司在深度昏迷时拒绝赔偿，需证明该情况不在合同中约定的保险责任范围内。同时，医疗人员也应当严格按照法律规定履行职责，以避免造成患者的重大损害。