法律分析：1、法律效力不同，商品房预售合同备案登记制度是一种行政管理制度，而预告登记是不动产登记制度，二者的法律效力完全不同。
2、登记的程序及部门不同。
法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》 第四十四条 商品房预售人应当按照国家有关规定将预售合同报县级以上房产管理部门和土地管理部门登记备案。