法律分析：竣工验收备案证明书由工程所在地的县级以上地方建设主管部门颁发。
法律依据：《房屋建筑和市政基础设施工程竣工验收备案管理办法》
第四条 建设单位应当自工程竣工验收合格之日起15日内，依照本办法规定，向工程所在地的县级以上地方建设主管部门备案。
第六条 备案机关收到建设单位报送的竣工验收备案文件，验证文件齐全后，应当在工程竣工验收备案表上签署文件收讫。工程竣工验收备案表一式两份，一份由建设单位保存，一份留备案机关存档。