在与政府部门建立合作关系时，管理者可以采取以下措施：
了解政府政策：及时了解政府部门发布的政策法规，掌握相关政策对企业的影响，有针对性地调整企业战略和运营。
建立良好的沟通渠道：与政府部门建立密切的沟通渠道，可以通过定期会议、交流活动等方式保持沟通畅通，及时沟通问题和需求。
参与决策过程：积极参与政府部门的决策过程，例如参加公职人员培训、行业咨询、政策制定等，有助于企业了解政府决策背后的考虑，提前预判政策变化。
合规合法经营：企业要保持合规合法经营，遵守相关法律法规，建立健全的内部合规体系，避免与政府部门发生纠纷。
积极参与社会责任：企业可以通过公益活动、社会责任项目等方式积极参与社会公益事业，赢得政府部门和公众的认可。
寻求第三方帮助：在与政府部门合作过程中，如遇到矛盾和纠纷，可以寻求第三方中介机构或律师等专业机构的帮助，协助解决问题。
案例分析：举例说明某企业与政府部门合作的案例，包括合作模式、取得的成果和遇到的挑战，可以帮助其他管理者更好地理解如何与政府部门建立合作关系。
总之，与政府部门建立有效的合作关系需要企业具备政策敏感性、沟通能力、合规合法经营意识，同时要积极参与社会责任，寻求第三方帮助，以确保与政府部门合作顺利进行，取得双赢的结果。