如果参考文献在论文的内容中，那么中国知网查重不会跳过参考文献部分，并且知网查重系统会读取参考文献的格式，如果格式正确，知网会将文献内容和自己的数据库进行比对，如果内容一致，那么就不会将文献内容计算到重复率之中。如果引用文献格式有误，知网查重系统就无法正确识别文献部分，并将引用的文献部分也计算到论文重复率之中。