基因家族|29个无脊椎动物SRCR基因超家族的全基因组比较分析揭示了海绵...
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发布时间：2024-10-12 14:55
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时间：2024-10-29 13:53
在《Int J.Mol.Sci.》2024年1月26日发表的文章“Genome-Wide Comparative Analysis of SRCR Gene Superfamily in Invertebrates Reveals Massive and Independent Gene Expansions in the Sponge and Sea Urchin”中，研究者们对无脊椎动物SRCR基因超家族进行了全面的基因组比较分析。无脊椎动物进化出了多样的非自我识别策略，其中一种适应性是在某些无脊椎动物中SRCR免疫受体基因超家族的扩展。本文调查了SRCR基因超家族在29个后生动物物种中的进化历史，特别关注无脊椎动物。分析了结构域构架、基因组位置和系统发育分布。
研究揭示，在昆士兰海绵（Amphimedon queenslandica）和紫海胆（Strongylocentrotus purpuratus）中SRCR-SF基因组内发生了广泛的复制。进一步的分子进化研究发现了海绵和海胆SRCR-SF中保守半胱氨酸的不同模式，表明了和收敛进化。在海绵SRCR-SF中，新发现了包含七个保守半胱氨酸的结构。基因复制、结构域变异和外显子-内含子分歧导致了海绵和海胆基因组中SRCR-SF扩展的收敛进化。研究还强调了SRCR-SF在强化无脊椎动物不同免疫功能中的潜在作用，特别是在免疫相关组织如消化腺的高表达。
结果表明，基因复制、结构域变异和外显子-内含子分歧可能导致了海绵和海胆基因组中SRCR-SF扩展的和收敛进化。该研究还表明SRCR-SF受体复制的利用可能是增加无脊椎动物免疫多样性和组织特异性的一种普遍和基本策略。
通过图1、表1、图2、图3、图4、图5、图6、图7、图8，研究者展示了SRCR-SF成员在29个代表性动物物种中的分布、组织特异性转录表达、基因组分布、基因结构分析以及不同类型的SRCR结构域基序和三维结构。这些结果为理解无脊椎动物SRCR基因家族的进化和功能提供了重要见解。
